Aus dem aktuellen Hochschulranking des Zentrums für Hochschulentwicklung geht hervor, dass die Studierenden der Uni Jena in den Fächern Chemie, Pharmazie und Mathematik mit der Betreuung durch ihre Hochschullehrer sehr zufrieden sind. Die Chemie kann zudem mit einer guten Ausstattung der Praktikumslabore und der Studiensituation insgesamt überzeugen, während in der Mathematik die IT-Infrastruktur Bestnoten erreicht. Die Sportwissenschaft landet in den Kategorien Studiensituation und Sportstätten in der Spitzengruppe. Das Fach Geographie punktet außerdem mit sehr gut bewerteten Exkursionen.
Neben der sehr guten Studiensituation schneidet die Universität Jena im aktuellen Hochschulranking auch bei den Forschungsgeldern hervorragend ab. Zur Spitzengruppe der deutschen Hochschulen in dieser Kategorie zählen die Physik, aber auch die Chemie, die Geographie und die Sportwissenschaft.
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